Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ERVV-1B6SEH8 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms