Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HMGB1P1B2RPK0 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HMGB1P1B2RPK0 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms