Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX8Q9Y5X2 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 242.1 ms