Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV7

PHF24, PHD finger protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF24Q9UPV7 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF24Q9UPV7 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms