Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD9

UBQLN2, Ubiquilin-2, humanhuman

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN2Q9UHD9 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBQLN2Q9UHD9 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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