Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNAL1Q9UBT7 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms