Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U7

SLC17A7, Vesicular glutamate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A7Q9P2U7 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC17A7Q9P2U7 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms