Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HCN3Q9P1Z3 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms