Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

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Length 571 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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