Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms