Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms