Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ZCCHC17Q9NP64 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZCCHC17Q9NP64 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101 ms