Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN0

GPR88, Probable G-protein coupled receptor 88, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR88Q9GZN0 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPR88Q9GZN0 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms