Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP44Q9C0F1 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms