Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM5Q9C035 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM5Q9C035 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM5Q9C035 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM5Q9C035 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM5Q9C035 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM5Q9C035 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM5Q9C035 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM5Q9C035 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM5Q9C035 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms