Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR4

KRTAP4-3, Keratin-associated protein 4-3, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-3Q9BYR4 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP4-3Q9BYR4 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms