Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms