Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC4A5Q9BY07 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms