Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SYCP2Q9BX26 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCP2Q9BX26 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms