Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC106Q9BWC9 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms