Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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