Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR4

FAM19A4, Protein FAM19A4, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM19A4Q96LR4 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
FAM19A4Q96LR4 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms