Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTP4Q96DX8 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms