Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

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Length 71 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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SPTSSAQ969W0 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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SPTSSAQ969W0 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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SPTSSAQ969W0 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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SPTSSAQ969W0 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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SPTSSAQ969W0 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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SPTSSAQ969W0 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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SPTSSAQ969W0 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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SPTSSAQ969W0 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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SPTSSAQ969W0 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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SPTSSAQ969W0 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPTSSAQ969W0 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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