Protein–RNA interactions for Protein: Q969S8

HDAC10, Histone deacetylase 10, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC10Q969S8 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC10Q969S8 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms