Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKD2Q969F2 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKD2Q969F2 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKD2Q969F2 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKD2Q969F2 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKD2Q969F2 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKD2Q969F2 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKD2Q969F2 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKD2Q969F2 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NKD2Q969F2 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKD2Q969F2 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKD2Q969F2 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKD2Q969F2 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKD2Q969F2 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NKD2Q969F2 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKD2Q969F2 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKD2Q969F2 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKD2Q969F2 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NKD2Q969F2 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NKD2Q969F2 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKD2Q969F2 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKD2Q969F2 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKD2Q969F2 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKD2Q969F2 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKD2Q969F2 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKD2Q969F2 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKD2Q969F2 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKD2Q969F2 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKD2Q969F2 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKD2Q969F2 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NKD2Q969F2 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NKD2Q969F2 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NKD2Q969F2 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD2Q969F2 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD2Q969F2 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD2Q969F2 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD2Q969F2 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD2Q969F2 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD2Q969F2 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD2Q969F2 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD2Q969F2 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD2Q969F2 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD2Q969F2 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD2Q969F2 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD2Q969F2 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD2Q969F2 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD2Q969F2 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD2Q969F2 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD2Q969F2 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD2Q969F2 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD2Q969F2 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD2Q969F2 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD2Q969F2 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD2Q969F2 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD2Q969F2 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD2Q969F2 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD2Q969F2 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD2Q969F2 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD2Q969F2 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD2Q969F2 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD2Q969F2 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD2Q969F2 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD2Q969F2 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD2Q969F2 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD2Q969F2 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD2Q969F2 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD2Q969F2 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD2Q969F2 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD2Q969F2 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD2Q969F2 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD2Q969F2 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD2Q969F2 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD2Q969F2 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD2Q969F2 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD2Q969F2 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD2Q969F2 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD2Q969F2 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD2Q969F2 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD2Q969F2 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD2Q969F2 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD2Q969F2 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD2Q969F2 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD2Q969F2 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD2Q969F2 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKD2Q969F2 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKD2Q969F2 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKD2Q969F2 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKD2Q969F2 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKD2Q969F2 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKD2Q969F2 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKD2Q969F2 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKD2Q969F2 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKD2Q969F2 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NKD2Q969F2 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKD2Q969F2 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKD2Q969F2 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKD2Q969F2 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKD2Q969F2 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NKD2Q969F2 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKD2Q969F2 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms