Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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ZNF548Q8NEK5 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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ZNF548Q8NEK5 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF548Q8NEK5 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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