Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBK3

SUMF1, Sulfatase-modifying factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMF1Q8NBK3 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SUMF1Q8NBK3 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms