Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9P6

C9orf163, Uncharacterized protein C9orf163, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf163Q8N9P6 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
C9orf163Q8N9P6 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
C9orf163Q8N9P6 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
C9orf163Q8N9P6 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
C9orf163Q8N9P6 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
C9orf163Q8N9P6 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
C9orf163Q8N9P6 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
C9orf163Q8N9P6 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
C9orf163Q8N9P6 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
C9orf163Q8N9P6 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
C9orf163Q8N9P6 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
C9orf163Q8N9P6 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
C9orf163Q8N9P6 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
C9orf163Q8N9P6 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
C9orf163Q8N9P6 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
C9orf163Q8N9P6 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
C9orf163Q8N9P6 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
C9orf163Q8N9P6 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
C9orf163Q8N9P6 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
C9orf163Q8N9P6 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
C9orf163Q8N9P6 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
C9orf163Q8N9P6 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
C9orf163Q8N9P6 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
C9orf163Q8N9P6 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
C9orf163Q8N9P6 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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C9orf163Q8N9P6 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
C9orf163Q8N9P6 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
C9orf163Q8N9P6 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
C9orf163Q8N9P6 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
C9orf163Q8N9P6 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
C9orf163Q8N9P6 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
C9orf163Q8N9P6 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
C9orf163Q8N9P6 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
C9orf163Q8N9P6 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
C9orf163Q8N9P6 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
C9orf163Q8N9P6 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
C9orf163Q8N9P6 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
C9orf163Q8N9P6 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
C9orf163Q8N9P6 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
C9orf163Q8N9P6 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
C9orf163Q8N9P6 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
C9orf163Q8N9P6 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
C9orf163Q8N9P6 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
C9orf163Q8N9P6 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
C9orf163Q8N9P6 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
C9orf163Q8N9P6 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
C9orf163Q8N9P6 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
C9orf163Q8N9P6 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
C9orf163Q8N9P6 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
C9orf163Q8N9P6 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
C9orf163Q8N9P6 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
C9orf163Q8N9P6 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
C9orf163Q8N9P6 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
C9orf163Q8N9P6 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
C9orf163Q8N9P6 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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