Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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C9orf40Q8IXQ3 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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C9orf40Q8IXQ3 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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C9orf40Q8IXQ3 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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C9orf40Q8IXQ3 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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C9orf40Q8IXQ3 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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C9orf40Q8IXQ3 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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C9orf40Q8IXQ3 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf40Q8IXQ3 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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