Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC117Q8IWD4 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms