Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms