Protein–RNA interactions for Protein: Q86TU6

LINC00523, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00523, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00523Q86TU6 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00523Q86TU6 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms