Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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TRAPPC6BQ86SZ2 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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TRAPPC6BQ86SZ2 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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TRAPPC6BQ86SZ2 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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TRAPPC6BQ86SZ2 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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TRAPPC6BQ86SZ2 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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TRAPPC6BQ86SZ2 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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TRAPPC6BQ86SZ2 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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TRAPPC6BQ86SZ2 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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TRAPPC6BQ86SZ2 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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