Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms