Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
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