Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 OLA1P2-201ENST00000395519 1264 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 BLOC1S5-205ENST00000543936 368 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 MIR6893-201ENST00000613458 69 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 AC005746.2-201ENST00000585765 470 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP350Q5VT06 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms