Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN2Q52LD8 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms