Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SP6Q3SY56 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
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