Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
CCDC27Q2M243 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC27Q2M243 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms