Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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