Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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GEN1Q17RS7 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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GEN1Q17RS7 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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