Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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PTPRNQ16849 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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PTPRNQ16849 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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PTPRNQ16849 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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PTPRNQ16849 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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PTPRNQ16849 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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PTPRNQ16849 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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PTPRNQ16849 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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PTPRNQ16849 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
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PTPRNQ16849 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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PTPRNQ16849 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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PTPRNQ16849 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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PTPRNQ16849 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRNQ16849 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
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