Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PCK2Q16822 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.4 ms