Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PDK4Q16654 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDK4Q16654 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms