Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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ZNF239Q16600 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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ZNF239Q16600 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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