Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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