Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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