Protein–RNA interactions for Protein: Q15119

PDK2, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK2Q15119 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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PDK2Q15119 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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PDK2Q15119 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK2Q15119 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.5 ms