Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COL19A1Q14993 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.5 ms